Der Vorstand der Mozartgemeinde wird jeweils für eine Funktionsperiode von vier Jahren gewählt. Der derzeitige Vorstand (2018 – 2022) setzt sich aus folgenden Personen zusammen:
| Präsidentin | Univ. Prof. Dr. Barbara Moser |
| Vizepräsident | SR Dr. Wolfgang Gerold |
| Generalsekretär | Dr. Roman Seeliger |
| Kassenverwalter/Mitgliederevidenz | David Hojsak, BA MA |
Weitere Vorstandsmitglieder:
| Univ. Prof. HR Dr. Günther Dembski |
| HR Dr. Rudolf Hopfner |
| Hofrat Dr. Dr.hc. Wolf Peschl |
| Dr. Stefan Zapotocky |
| Mag. Ingrid Marsoner |